50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1278 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1278  Fe2+ transport system protein A  100 
 
 		 81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000112175  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1504  ferrous iron transport protein A, putative  92.59 
 
 		 81 aa  151  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000033776  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1294  FeoA family protein  90.12 
 
 		 81 aa  146  8e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000485468  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1140  FeoA family protein  51.25 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05060  FeoA family protein  48.72 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251692  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0530  FeoA family protein  50 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2158  hypothetical protein  34.67 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1505  FeoA family protein  37.33 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.625301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0662  putative Fe2+ transport protein  32.88 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1568  FeoA family protein  40 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0187  FeoA family protein  29.49 
 
 		 80 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587715  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0634  FeoA family protein  41.54 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000754558  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0319  FeoA family protein  41.43 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2491  FeoA family protein  38.03 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2417  FeoA family protein  40.28 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0849  FeoA family protein  36.99 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0971  FeoA family protein  40.85 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0265953 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4561  ferrous iron transport protein A  33.77 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000390936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4966  FeoA family protein  33.77 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  34.29 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0902  FeoA family protein  32.86 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0959583  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2065  FeoA family protein  32 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000946175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4933  FeoA family protein  36 
 
 		 75 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4948  FeoA family protein  36 
 
 		 75 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0306  FeoA family protein  34.67 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4643  FeoA family protein  36 
 
 		 75 aa  44.3  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0542  FeoA family protein  32.39 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000870472  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.38 
 
 		 239 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1750  FeoA family protein  26.32 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000170753  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2697  FeoA family protein  29.17 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0855124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  31.43 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0975  FeoA family protein  34.21 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00201528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1730  FeoA family protein  29.17 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285273  normal  0.0385083 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4929  FeoA family protein  34.67 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4704  FeoA family protein  34.67 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1434  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000297198  normal  0.0224554 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5065  FeoA family protein  34.67 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4543  ferrous iron transport protein A  34.67 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0317  FeoA family protein  29.87 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2189  FeoA family protein  31.94 
 
 		 81 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000240833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2808  FeoA family protein  37.29 
 
 		 83 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0466  FeoA family protein  32.43 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1098  ferrous iron transport protein A  31.58 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1819  ferrous iron transport protein A  32.43 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2670  ferrous iron transport protein A, putative  29.73 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.501663  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03985  probable ferrous iron transport protein A  28.77 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22720  ferrous iron transport protein A  35.21 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2488  FeoA family protein  31.25 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0778  hypothetical protein  34.25 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1599  iron(II) transport protein A  32.43 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>