22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0403 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0403  arsenate reductase and related  100 
 
 
118 aa  237  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1805  arsenate reductase-like protein  58.41 
 
 
116 aa  137  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2231  arsenate reductase and related  41.28 
 
 
112 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.376632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2937  arsenate reductase and related  38.94 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0973954  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2309  arsenate reductase and related  35.71 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1470  arsenate reductase and related  40.91 
 
 
113 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.222318  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0726  arsenate reductase and related  35.78 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000014024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2438  arsenate reductase  25.44 
 
 
116 aa  50.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2168  arsenate reductase  25.44 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3594  arsenate reductase  18.97 
 
 
117 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  26.32 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  21.62 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  25 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  20.35 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  26.09 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  26.55 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  24.56 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  24.04 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  23.42 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2247  arsenate reductase-like protein  23.01 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  24.04 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  23.85 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>