18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3979 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3979  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  146  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0178163  normal  0.514914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5701  hypothetical protein  95.89 
 
 
73 aa  143  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1844  hypothetical protein  91.78 
 
 
73 aa  140  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2575  hypothetical protein  87.67 
 
 
73 aa  135  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.924076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6891  hypothetical protein  83.56 
 
 
73 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.39159 
 
 
-
 
NC_002950  PG0286  hypothetical protein  82.19 
 
 
85 aa  127  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09096  hypothetical protein  83.56 
 
 
73 aa  126  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0464  hypothetical protein  80.82 
 
 
73 aa  124  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0368  hypothetical protein  80.82 
 
 
73 aa  124  6e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5003  hypothetical protein  79.45 
 
 
73 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2554  hypothetical protein  83.1 
 
 
73 aa  121  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1647  hypothetical protein  61.11 
 
 
75 aa  97.1  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0534  hypothetical protein  61.11 
 
 
75 aa  97.1  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0493  hypothetical protein  60.27 
 
 
75 aa  95.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.947797  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0471  hypothetical protein  58.33 
 
 
75 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0538  hypothetical protein  61.11 
 
 
75 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0177  hypothetical protein  58.33 
 
 
75 aa  94  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0653  hypothetical protein  55.56 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.75011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>