21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3398 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3398  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  100 
 
 
89 aa  186  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  39.76 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1211  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  40 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56263  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1449  hypothetical protein  38.67 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1142  hypothetical protein  40.58 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  30.68 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  31.65 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1066  hypothetical protein  36.36 
 
 
93 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2376  hypothetical protein  28.74 
 
 
80 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  30.68 
 
 
91 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1134  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.372045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  27.59 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1091  hypothetical protein  34.78 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.764495  normal  0.106825 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  26.19 
 
 
88 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  25.93 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  26.19 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  27.91 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1900  hypothetical protein  31.03 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1403  hypothetical protein  34.33 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  27.63 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1285  hypothetical protein  34.33 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>