20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2729 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2729  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  339  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0989  hypothetical protein  62.2 
 
 
188 aa  218  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1823  hypothetical protein  37.5 
 
 
178 aa  114  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0953844 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0313  hypothetical protein  36.02 
 
 
163 aa  101  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.686575  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0604  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  96.7  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00690  hypothetical protein  31.9 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1847  hypothetical protein  37.42 
 
 
172 aa  89  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0147  hypothetical protein  32.93 
 
 
179 aa  85.1  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0247  hypothetical protein  32.91 
 
 
167 aa  85.1  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5918  hypothetical protein  35.93 
 
 
171 aa  84.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939789  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1999  hypothetical protein  32.12 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000126346  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2060  hypothetical protein  29.17 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2332  hypothetical protein  26.22 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000503232  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1799  hypothetical protein  26.83 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1638  hypothetical protein  25.75 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0414  hypothetical protein  27.63 
 
 
166 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.683154  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2004  hypothetical protein  26.76 
 
 
169 aa  57.4  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1968  hypothetical protein  25.61 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000218249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2115  lipoprotein, putative  31.1 
 
 
167 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3133  hypothetical protein  22.81 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>