14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0666 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0666  hypothetical protein  100 
 
 
1193 aa  2460    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447807  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2554  hypothetical protein  39.15 
 
 
1131 aa  486  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1677  hypothetical protein  38.51 
 
 
1131 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3605  hypothetical protein  34.13 
 
 
863 aa  348  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000881284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1046  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  35.87 
 
 
895 aa  343  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3159  hypothetical protein  30.97 
 
 
900 aa  297  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0980935  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1083  hypothetical protein  26.37 
 
 
831 aa  185  4.0000000000000006e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0364  hypothetical protein  26.96 
 
 
821 aa  171  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5245  hypothetical protein  30.83 
 
 
2204 aa  166  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291359  hitchhiker  0.0000299325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3932  hypothetical protein  25.38 
 
 
921 aa  159  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0926169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2998  hypothetical protein  24.14 
 
 
906 aa  147  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2457  hypothetical protein  28.68 
 
 
866 aa  107  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0520379  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0671  hypothetical protein  38.54 
 
 
831 aa  79.3  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5244  hypothetical protein  32.93 
 
 
175 aa  45.8  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000191659  hitchhiker  0.000000566819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>