27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0191 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0191  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  520  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0804996  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1402  hypothetical protein  58.78 
 
 
247 aa  293  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.526753  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6529  hypothetical protein  50.63 
 
 
240 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal  0.0666444 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1719  hypothetical protein  55.17 
 
 
239 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2096  hypothetical protein  51.03 
 
 
246 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.756279  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2555  hypothetical protein  49.38 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347074  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3620  hypothetical protein  45.87 
 
 
249 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118154  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0817  protein EcsC  46.25 
 
 
235 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0981  EcsC protein  47.03 
 
 
235 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1050  hypothetical protein  47.03 
 
 
235 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1127  EcsC protein  47.03 
 
 
235 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1215  EcsC protein  47.03 
 
 
235 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1154  EcsC protein  47.03 
 
 
235 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0960  EcsC-like protein  47.03 
 
 
235 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0970  protein EcsC  47.03 
 
 
235 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4218  EcsC protein  46.19 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.518575  normal  0.0909474 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1086  EcsC protein  46.19 
 
 
235 aa  188  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0965  EcsC protein  46.19 
 
 
235 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2086  hypothetical protein  22.94 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0529  hypothetical protein  21.1 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2633  hypothetical protein  24.34 
 
 
270 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3309  hypothetical protein  27.1 
 
 
277 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.287596  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1915  cation transporter E1-E2 family ATPase  21.69 
 
 
1068 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2872  hypothetical protein  25.83 
 
 
269 aa  52  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4743  hypothetical protein  26.09 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0492  hypothetical protein  26.09 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4409  hypothetical protein  21.46 
 
 
308 aa  42  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>