24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2556 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2556  Phage uncharacterized protein-like  100 
 
 
505 aa  1050    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0639  hypothetical protein  66.41 
 
 
519 aa  699    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0679794  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2305  phage uncharacterized protein, putative  53.26 
 
 
491 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1106  phage uncharacterized protein-like protein  60.77 
 
 
601 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.139903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0801  Phage uncharacterized protein-like  29.19 
 
 
466 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0224  phage uncharacterized protein  23.12 
 
 
488 aa  67  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00823  phage uncharacterized protein  23.4 
 
 
913 aa  65.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0967  phage uncharacterized protein  22.22 
 
 
465 aa  56.2  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.451476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3672  hypothetical protein  22.77 
 
 
505 aa  54.3  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4228  phage uncharacterized protein  22.89 
 
 
594 aa  54.3  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.76146  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0804  phage uncharacterized protein  25.15 
 
 
485 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0249  phage uncharacterized protein  21.46 
 
 
527 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2384  phage protein  20.98 
 
 
571 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1132  phage uncharacterized protein  22.33 
 
 
295 aa  51.2  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0014  hypothetical protein  23.27 
 
 
484 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0377  Phage uncharacterized protein, C-terminal  18.48 
 
 
469 aa  49.3  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0430074  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1016  phage uncharacterized protein  22.33 
 
 
487 aa  48.5  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0660227  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0302  chaperone and heat shock protein 70  26.09 
 
 
484 aa  45.8  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.763978  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0665  phage uncharacterized protein  18.6 
 
 
469 aa  45.1  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.410967  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3004  Phage uncharacterized protein-like  23.26 
 
 
484 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3908  phage uncharacterized protein  21.24 
 
 
555 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0814  phage uncharacterized protein  26.57 
 
 
451 aa  43.5  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.93566  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0755  hypothetical protein  23.86 
 
 
546 aa  43.5  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.891172  normal  0.995828 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0542  phage uncharacterized protein  22.59 
 
 
495 aa  43.5  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>