18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1968 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1968  TRASH  100 
 
 		 100 aa  208  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0363  TRASH domain protein  58.16 
 
 		 98 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00964883 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1429  TRASH domain-containing protein  60 
 
 		 99 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1187  TRASH domain-containing protein  60.64 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.254659  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1349  TRASH domain protein  48.15 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.407824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1455  TRASH  46.34 
 
 		 83 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00129945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0704  hypothetical protein  41.86 
 
 		 79 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2978  hypothetical protein  36.47 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0374  hypothetical protein  31.71 
 
 		 83 aa  50.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.72923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0052  TRASH domain-containing protein  38.3 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  30.86 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0609  TRASH domain protein  40.96 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0623  TRASH domain protein  38.55 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.34319e-36 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0496  hypothetical protein  30.77 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  48.65 
 
 		 463 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 1020 aa  40  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 841 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  42.22 
 
 		 846 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>