14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1912 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1912  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  308  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2722  hypothetical protein  46.02 
 
 
301 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000050933  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1661  hypothetical protein  36.73 
 
 
132 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1054  hypothetical protein  38.68 
 
 
443 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3646  hypothetical protein  33.03 
 
 
414 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3447  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3014  hypothetical protein  31.18 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3265  hypothetical protein  30.21 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2334  hypothetical protein  30.53 
 
 
141 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2395  hypothetical protein  31.18 
 
 
300 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1194  hypothetical protein  31.58 
 
 
450 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255912  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3705  hypothetical protein  40 
 
 
417 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5510  hypothetical protein  40 
 
 
417 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1810  hypothetical protein  24.51 
 
 
411 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>