39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1112 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1112  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  305  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00144751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2830  HAD family hydrolase  51.92 
 
 
156 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1236  hypothetical protein  56.13 
 
 
156 aa  164  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1135  hypothetical protein  49.68 
 
 
155 aa  143  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2299  hypothetical protein  47.1 
 
 
156 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0021594  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0027  hypothetical protein  49.37 
 
 
156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1711  hypothetical protein  45.39 
 
 
155 aa  134  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000195986  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0593  hypothetical protein  49.04 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0830  soluble P-type ATPase  41.94 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25270  soluble P-type ATPase  44.37 
 
 
154 aa  123  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0968329 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1180  hypothetical protein  50.64 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.944923 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1184  hypothetical protein  41.03 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0282  hypothetical protein  41.29 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1047  hypothetical protein  47.74 
 
 
156 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0725  HAD family hydrolase  37.25 
 
 
149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0477  HAD family hydrolase  36.31 
 
 
149 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0341937  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0424  hypothetical protein  46.53 
 
 
160 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1442  HAD family hydrolase  34.29 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0360  hypothetical protein  32.59 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.171021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0545  HAD family hydrolase  33.05 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0908352  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0917  heavy metal translocating P-type ATPase  31.4 
 
 
641 aa  47.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2866  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
655 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  27.82 
 
 
794 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0621  phosphoserine phosphatase  35.16 
 
 
220 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  55 
 
 
297 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  30.43 
 
 
814 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  30.43 
 
 
814 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  57.5 
 
 
297 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_002950  PG0938  calcium-transporting ATPase  29.66 
 
 
1063 aa  41.2  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0829843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 
679 aa  41.6  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3641  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
656 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  28.69 
 
 
803 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  46.55 
 
 
404 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1340  copper-translocating P-type ATPase  26.27 
 
 
796 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  28.69 
 
 
803 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  29.06 
 
 
796 aa  40.8  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  28.46 
 
 
799 aa  40.8  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  46.55 
 
 
429 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  57.5 
 
 
261 aa  40.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>