28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3817 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3817  monooxygenase component MmoB/DmpM  100 
 
 
146 aa  305  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0643335  normal  0.059628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1313  monooxygenase component MmoB/DmpM  64.42 
 
 
104 aa  141  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3559  monooxygenase component MmoB/DmpM  57.69 
 
 
104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4635  monooxygenase component MmoB/DmpM  57.69 
 
 
104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5676  monooxygenase component MmoB/DmpM  58 
 
 
105 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0817  toluene monooxygenase activator  59.41 
 
 
102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2542  toluene monooxygenase activator  60.22 
 
 
108 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4860  monooxygenase component MmoB/DmpM  52.27 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111656  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1595  toluene-4-monooxygenase system protein D  37.5 
 
 
99 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2199  monooxygenase component MmoB/DmpM  35.96 
 
 
115 aa  60.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.031469  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0543  monooxygenase component MmoB/DmpM  34.44 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13468  normal  0.713388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3114  monooxygenase component MmoB/DmpM  34.25 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0214  monooxygenase component MmoB/DmpM  31.63 
 
 
101 aa  53.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.222337 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4629  monooxygenase component MmoB/DmpM  32.93 
 
 
89 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3553  monooxygenase component MmoB/DmpM  32.93 
 
 
89 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5682  monooxygenase component MmoB/DmpM  31.71 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3795  monooxygenase component MmoB/DmpM  30.14 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0289368  hitchhiker  0.00231767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3307  phenol hydrolase activator  31.58 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.560355  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3309  monooxygenase component MmoB/DmpM  26.97 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2283  phenol hydrolase activator  30.67 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30740  Multi-component phenol hydoxylase, activator subunit; LapM  26.83 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2794  monooxygenase component MmoB/DmpM  28.77 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0525  monooxygenase component MmoB/DmpM  32.84 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08840  phenol hydroxylase, monooxygenase component P2  28.09 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3361  monooxygenase component MmoB/DmpM  28.77 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1785  monooxygenase component MmoB/DmpM  30.26 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2969  monooxygenase component MmoB/DmpM  30.26 
 
 
89 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257392  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0208  monooxygenase component MmoB/DmpM  27.4 
 
 
89 aa  40  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>