26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3795 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3795  monooxygenase component MmoB/DmpM  100 
 
 
89 aa  181  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0289368  hitchhiker  0.00231767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3114  monooxygenase component MmoB/DmpM  74.16 
 
 
89 aa  142  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30740  Multi-component phenol hydoxylase, activator subunit; LapM  68.54 
 
 
89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1329  monooxygenase component MmoB/DmpM  66.29 
 
 
89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3307  phenol hydrolase activator  69.32 
 
 
96 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.560355  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0208  monooxygenase component MmoB/DmpM  64.04 
 
 
89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5682  monooxygenase component MmoB/DmpM  62.92 
 
 
89 aa  123  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4629  monooxygenase component MmoB/DmpM  61.8 
 
 
89 aa  123  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3553  monooxygenase component MmoB/DmpM  61.8 
 
 
89 aa  123  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2969  monooxygenase component MmoB/DmpM  64.04 
 
 
89 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257392  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3361  monooxygenase component MmoB/DmpM  59.55 
 
 
89 aa  120  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2794  monooxygenase component MmoB/DmpM  58.43 
 
 
89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1785  monooxygenase component MmoB/DmpM  59.77 
 
 
90 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1701  monooxygenase component MmoB/DmpM  57.65 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687174  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2283  phenol hydrolase activator  59.52 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3309  monooxygenase component MmoB/DmpM  48.84 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08840  phenol hydroxylase, monooxygenase component P2  47.67 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0525  monooxygenase component MmoB/DmpM  42.68 
 
 
101 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3559  monooxygenase component MmoB/DmpM  32.47 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4635  monooxygenase component MmoB/DmpM  32.47 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5676  monooxygenase component MmoB/DmpM  31.17 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3817  monooxygenase component MmoB/DmpM  30.14 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0643335  normal  0.059628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0817  toluene monooxygenase activator  28.92 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2542  toluene monooxygenase activator  27.27 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1313  monooxygenase component MmoB/DmpM  30.67 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1378  monooxygenase component MmoB/DmpM  28.57 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>