22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2926 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2926  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.369308  normal  0.384731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1245  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  71.69 
 
 		 273 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6013  xylose isomerase-like TIM barrel  58.09 
 
 		 275 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.920316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2074  xylose isomerase-like TIM barrel  57.78 
 
 		 274 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2685  xylose isomerase domain-containing protein  57.78 
 
 		 274 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2738  xylose isomerase domain-containing protein  57.14 
 
 		 276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3284  xylose isomerase domain-containing protein  60 
 
 		 276 aa  304  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00754219 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0612  xylose isomerase domain-containing protein  59.56 
 
 		 275 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2714  xylose isomerase domain-containing protein  57.78 
 
 		 274 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3270  AP endonuclease  53.58 
 
 		 276 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187779  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3496  iolI protein  52.45 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50090  myo-inositol catabolism protein  54.72 
 
 		 280 aa  262  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4269  xylose isomerase domain-containing protein  46.47 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.48 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0110067  normal  0.529558 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1677  xylose isomerase domain-containing protein  52.24 
 
 		 266 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7181  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.86 
 
 		 270 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123498  normal  0.0907339 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2319  xylose isomerase domain-containing protein  53.05 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.58 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4717  xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.59 
 
 		 271 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4665  xylose isomerase domain-containing protein  33.09 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.6 
 
 		 286 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4709  myo-inositol catabolism protein  25.1 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0492702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>