12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1931 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1931  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  543  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0476094  hitchhiker  0.0000000997177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1152  hypothetical protein  53.28 
 
 
400 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.303869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2402  hypothetical protein  35.42 
 
 
344 aa  155  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1758  hypothetical protein  65.57 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3853  hypothetical protein  40.38 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878224  hitchhiker  0.000000470201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4006  hypothetical protein  32.76 
 
 
293 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464817  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0578  hypothetical protein  39.68 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.044729  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1431  hypothetical protein  34.88 
 
 
368 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.464405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3621  hypothetical protein  34.07 
 
 
283 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0768512  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1059  hypothetical protein  34.88 
 
 
295 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000696221  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0188  hypothetical protein  28.87 
 
 
338 aa  49.7  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1064  hypothetical protein  55 
 
 
164 aa  48.1  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>