13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1705 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1705  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  400  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.614952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3153  hypothetical protein  28.21 
 
 
261 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5215  hypothetical protein  28.21 
 
 
261 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5059  hypothetical protein  28.21 
 
 
268 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5595  hypothetical protein  38.98 
 
 
250 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5413  hypothetical protein  38.98 
 
 
250 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526467  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  33.33 
 
 
366 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  32.47 
 
 
397 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  38.3 
 
 
433 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  27.48 
 
 
331 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  27.48 
 
 
342 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  22.4 
 
 
378 aa  41.2  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  22.4 
 
 
378 aa  41.2  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>