18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1143 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1143  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  531  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0972  membrane protein-like protein  85.71 
 
 		 287 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000387152  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_961  hypothetical protein  89.26 
 
 		 273 aa  434  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0043963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  37.16 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4306  hypothetical protein  41.24 
 
 		 271 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0689253  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2469  hypothetical protein  36.92 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0240538 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04240  predicted membrane protein  36.59 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0185  hypothetical protein  31.62 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0220  hypothetical protein  26.7 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0226  hypothetical protein  26.7 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2198  hypothetical protein  26.61 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07980  Protein of unknown function (DUF2510)  34.86 
 
 		 354 aa  52.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0996646  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  28.87 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  27.34 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  30.71 
 
 		 439 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 406 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  28.76 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  34.58 
 
 		 444 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>