16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1258 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1258  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000323841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1228  hypothetical protein  99.51 
 
 		 204 aa  400  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3521  TPR domain protein  36.7 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2166  hypothetical protein  46.27 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2811  tetratricopeptide repeat-containing protein  32.93 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0556541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0878  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.47 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.213788  hitchhiker  0.0000283657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2395  tetratricopeptide TPR_2  37.9 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1134  TPR repeat-containing protein  49.12 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1164  TPR repeat-containing protein  49.12 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.660548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0350  hypothetical protein  36.05 
 
 		 132 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0301232  normal  0.125354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4498  Tetratricopeptide domain protein  32.93 
 
 		 284 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0666  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.107374  normal  0.0631773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 342 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 292 aa  44.7  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 331 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0755  TPR repeat-containing protein  40.32 
 
 		 730 aa  42  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>