16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0678 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0678  Phycobilisome protein  100 
 
 
156 aa  320  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109785  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3168  Phycobilisome protein  49.03 
 
 
156 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677974  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1058  Phycobilisome protein  47.13 
 
 
157 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1087  Phycobilisome protein  47.13 
 
 
157 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4420  Phycobilisome protein  40.26 
 
 
154 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1090  hypothetical protein  40.91 
 
 
156 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.548026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1093  hypothetical protein  29.17 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  26.97 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1055  hypothetical protein  25.34 
 
 
166 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  27.06 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1084  hypothetical protein  25.34 
 
 
166 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.446111  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  20.72 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  25.88 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  25.88 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32 
 
 
562 aa  41.2  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  28.21 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.445808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>