More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0001 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_R0001  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00002  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00307219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0010  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0312257  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0039  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00060  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0512928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00072  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0005  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00430225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0057  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0125445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0018  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000122806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0076  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000601074  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0101  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00826965  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0113  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000340482  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t37  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295961  normal  0.0193801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t39  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304224  normal  0.0192594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t41  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0706595  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4221  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0003  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0369112  normal  0.119668 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4292  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000724507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5005  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000268142  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4715  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490534  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5093  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000403795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5076  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000555714  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0017  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161415  hitchhiker  0.00407434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0156  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223913  hitchhiker  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0008  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000976028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t004  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t063  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t070  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0049  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t095  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4222  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.27944e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4205  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0103  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000241452  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0116  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000551315  hitchhiker  0.000206689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0083  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00420307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0011  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000768002  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0174  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0009  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0037  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0515316  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0136  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00216057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0073  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0071  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0077  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000406262  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0008  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000639755  hitchhiker  0.000460021 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0095  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0130404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0013  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00682305  normal  0.0131839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0075  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0066  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000458923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R32  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R34  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1997  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0080  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00215161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0021  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0879619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1995  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0036  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000477203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0043  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0457533  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0051  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000604865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0044  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000111435  normal  0.0314224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0047  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.055133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2740  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000025557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0051  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0004  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000571046  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0047  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000145993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0076  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000128408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0075  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000128408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00468  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4264  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000257856  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4642  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000860884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06829  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4703  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422544  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0084  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0403496  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0071  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.116303  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0009  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331872  normal  0.306257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0062  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000778147  normal  0.022465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0064  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000617351  normal  0.0220533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0073  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0694926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0009  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.441626  hitchhiker  0.00992497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0022  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000187329  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0062  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000770874  normal  0.663718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0064  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000015576  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0073  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0105913  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0035  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0036  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0009  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0330321  hitchhiker  0.00801031 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0025  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0092  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.892072  normal  0.128947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23570  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.981863  normal  0.0268964 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0052  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00660859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0012  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133641  hitchhiker  0.000473278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0009  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00140514  normal  0.720887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0060  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000591053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0062  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000152195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0071  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000469836  normal  0.108632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0134  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000329737  normal  0.0145655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0006  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0023212  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0024  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000443957  unclonable  0.00000686591 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0052  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0311944  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0469  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000319828  normal  0.0257822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0128  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000050642  normal  0.0403899 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0627  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351596  normal  0.0173581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>