13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2994 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2994  Patatin  100 
 
 
666 aa  1307    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  0.264647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1993  putative suppressor  36.04 
 
 
630 aa  273  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0216  Patatin  35.78 
 
 
624 aa  266  8e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2024  patatin  33.67 
 
 
631 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.103399 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0563  thermosensitive mutation transmembrane protein, SuhR  40 
 
 
605 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0531  hypothetical protein  37.94 
 
 
605 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1013  hypothetical protein  33.6 
 
 
782 aa  243  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.757168  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4103  patatin  34.7 
 
 
685 aa  230  6e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000427908 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0560  thermosensitive mutation transmembrane protein, SuhR  38.35 
 
 
605 aa  210  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3069  hypothetical protein  37.68 
 
 
782 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5875  Patatin  29.53 
 
 
646 aa  128  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  27.68 
 
 
341 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  54.17 
 
 
332 aa  47.4  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>