23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2264 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2264  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  100 
 
 		 198 aa  374  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2367  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  41.92 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1612  V-type ATPase, E subunit  37.62 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1893  V-type ATPase, E subunit  37.62 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0855  H+transporting two-sector ATPase E subunit  29.02 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0552  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  32.18 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0295  H+transporting two-sector ATPase E subunit  31.68 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.616118 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1618  H+transporting two-sector ATPase E subunit  31.19 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.620673  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0062  H+transporting two-sector ATPase E subunit  31.19 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0364  H+transporting two-sector ATPase E subunit  29.7 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.285147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3075  H+transporting two-sector ATPase E subunit  29.32 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1692  H+transporting two-sector ATPase E subunit  26.98 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1689  H+transporting two-sector ATPase E subunit  25.13 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1240  V-type ATP synthase subunit E  25 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1762  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  31.29 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0389  V-type ATP synthase subunit E  23.5 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0253  hypothetical protein  28.8 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1825  hypothetical protein  26.15 
 
 		 228 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.539213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0278  V-type ATP synthase subunit E  22.7 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.591531 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1434  V-type ATP synthase subunit E  23.65 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2084  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  23.76 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.490095  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0813  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  28.84 
 
 		 215 aa  42  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1773  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  28.79 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>