30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1616 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2823  phage minor structural protein  73.37 
 
 
839 aa  1300    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1265  phage minor structural protein  78.9 
 
 
840 aa  1420    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1616  phage minor structural protein  100 
 
 
840 aa  1731    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2593  phage minor structural protein  30.03 
 
 
855 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1849  phage minor structural protein  27.27 
 
 
466 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0322579  normal  0.615795 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1707  phage minor structural protein  24.86 
 
 
634 aa  89.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0457  phage minor structural protein  26.12 
 
 
544 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0481  phage minor structural protein  26.12 
 
 
544 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1144  phage tail fiber protein  27.76 
 
 
1239 aa  77.4  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.305507  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2638  phage minor structural protein  27.6 
 
 
730 aa  76.6  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0220022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13990  hypothetical protein  29.06 
 
 
341 aa  73.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3414  phage minor structural protein  21.69 
 
 
2399 aa  64.3  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  22.69 
 
 
2196 aa  62.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2686  phage minor structural protein  21.37 
 
 
1544 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1391  minor structural protein  23.16 
 
 
1439 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000302935 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0673  phage minor structural protein  21.02 
 
 
1585 aa  54.7  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4078  phage minor structural protein  21.79 
 
 
660 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3789  phage minor structural protein  21.79 
 
 
660 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3579  phage minor structural protein  21.97 
 
 
1564 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.790906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2933  phage minor structural protein  21.52 
 
 
1496 aa  52.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0509957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4372  putative minor structural protein  22.94 
 
 
538 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3494  prophage LambdaBa01, minor structural protein  21.58 
 
 
883 aa  52.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3411  phage-related protein; prophage LambdaBa01, minor structural protein  21.58 
 
 
1625 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1574  putative phage structural protein  24.77 
 
 
1019 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5851  hypothetical protein  22.16 
 
 
1986 aa  49.3  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2250  minor structural protein  20.95 
 
 
1341 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.069848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2402  structural protein  20.17 
 
 
1524 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00631563  normal  0.821189 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1642  hypothetical protein  23.56 
 
 
2681 aa  47.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2584  phage minor structural protein  21.58 
 
 
1341 aa  46.6  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0192234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2634  minor structural protein  21.45 
 
 
1343 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>