75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1542 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1542  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C  100 
 
 		 97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.825224  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0539  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  38.95 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1870  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  35.11 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1936  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  35.11 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1890  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  35.11 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0361468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3192  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  32.22 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  36.47 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3383  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  35.79 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_1518  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  34.74 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000177013  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_4325  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  39.02 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000645293  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1869  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  35.37 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0286  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  35.56 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000201197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1153  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  37.04 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2828  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C  34.18 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_0499  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C  28.28 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09810  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C  26.88 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0818596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0076  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C  36.26 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3087  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  32.97 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000636383  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_2114  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  31.91 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.478342  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_1169  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  38.55 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_0152  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  31.71 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00287833  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_2168  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  32.63 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1317  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  31.46 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
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NC_009565  TBFG_13027  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  27.66 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0141195  normal  0.5389 
 
 
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NC_011832  Mpal_1296  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  31.46 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.74286 
 
 
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NC_011899  Hore_02320  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  36.67 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00698191  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_1707  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase C subunit  33.33 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.466836  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_3504  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  34.09 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.116929 
 
 
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NC_011146  Gbem_3643  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  32.93 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_3750  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  32.93 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_3560  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  34.18 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.192242  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_4339  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  31.11 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8075  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  33.33 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0368292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2067  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  31.52 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.800191  normal  0.196957 
 
 
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NC_007777  Francci3_3645  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C  28.42 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1021  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C  30 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0554559  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_0297  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  29.41 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_0463  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  32.29 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_1143  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  31.91 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0393  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  29.41 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0366  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  29.41 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4954  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  29.41 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  29.41 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0300  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  29.41 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0291  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  29.41 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0288  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  29.41 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0305  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  29.41 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_3984  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  31.91 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.854117  normal  0.0232469 
 
 
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NC_009712  Mboo_0856  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  30 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.291516  normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_0320  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  29.41 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0349  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  29.41 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_2322  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C  28.89 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_6768  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  36.36 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_12640  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  32.86 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0972  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  32.88 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.160882  normal  0.605744 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0939  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  32.88 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.896613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1032  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  31.18 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.936689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0932  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  32.88 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.772909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0696  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C  27.5 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008639  Cpha266_2082  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  32.73 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3586  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  29.47 
 
 		 96 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237584  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0372  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  31.71 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639605  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0337  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  31.71 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0220813  normal  0.165722 
 
 
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NC_010803  Clim_2041  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  28 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1768  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  31.46 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0084  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  32.97 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3243  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  31.25 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03141  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  28.09 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2167  glutamyl-tRNA (Gln) amidotransferase, C subunit, GatC-like  30.49 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0152061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0764  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  31.25 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000864903  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2395  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, C subunit  30.38 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.763304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08730  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C  29.03 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1669  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  26.67 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0204692  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_18890  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C  28.26 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0406135  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4283  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  31.51 
 
 		 95 aa  40  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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