22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1455 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1455  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  467  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000773968  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0764  hypothetical protein  60.63 
 
 
222 aa  304  7e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0471664  normal  0.441546 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1280  hypothetical protein  46.67 
 
 
233 aa  229  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1988  hypothetical protein  49.54 
 
 
229 aa  228  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf079  conserved hypothetical protein, possible DNA alkylation repair enzyme  46.36 
 
 
246 aa  205  4e-52  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.389712  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1460  hypothetical protein  36 
 
 
230 aa  167  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2175  hypothetical protein  30.97 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.094597  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0119  hypothetical protein  30.97 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0820  hypothetical protein  28.07 
 
 
270 aa  104  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1508  hypothetical protein  27.05 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00485702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2664  hypothetical protein  25 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  21 
 
 
237 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  21 
 
 
237 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  21 
 
 
237 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  20.5 
 
 
237 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  20 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  20.5 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  20 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  27.69 
 
 
234 aa  42.4  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  20 
 
 
237 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  20 
 
 
237 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  19.5 
 
 
237 aa  41.6  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>