17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6882 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6882  hypothetical protein  100 
 
 		 669 aa  1388    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2537  hypothetical protein  33.84 
 
 		 675 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3878  hypothetical protein  30.14 
 
 		 705 aa  311  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5160  hypothetical protein  29.1 
 
 		 692 aa  256  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.307901 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1497  hypothetical protein  28.19 
 
 		 685 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.559508 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2457  hypothetical protein  25.47 
 
 		 663 aa  211  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0442  hypothetical protein  25.81 
 
 		 667 aa  163  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.57789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1687  hypothetical protein  25.54 
 
 		 692 aa  160  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0478  hypothetical protein  25.92 
 
 		 656 aa  158  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.522287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0543  hypothetical protein  26.11 
 
 		 686 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1977  hypothetical protein  26.86 
 
 		 668 aa  147  7.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1996  hypothetical protein  24.35 
 
 		 673 aa  147  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0498  hypothetical protein  24.78 
 
 		 678 aa  140  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1174  hypothetical protein  23.22 
 
 		 658 aa  135  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0495  hypothetical protein  25.62 
 
 		 687 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.591683  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0209  hypothetical protein  23.35 
 
 		 262 aa  51.2  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1982  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  32.26 
 
 		 274 aa  44.3  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000014049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>