28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6788 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6788  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  368  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.119156 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2535  hypothetical protein  45.51 
 
 
178 aa  164  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0582943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2561  hypothetical protein  46.71 
 
 
178 aa  163  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00328994 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2721  hypothetical protein  45.51 
 
 
181 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.931397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2739  hypothetical protein  46.11 
 
 
178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2783  hypothetical protein  43.71 
 
 
178 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2459  hypothetical protein  44.31 
 
 
178 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2495  hypothetical protein  43.71 
 
 
178 aa  158  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000659844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2766  hypothetical protein  43.53 
 
 
178 aa  158  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401115  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4253  hypothetical protein  47.09 
 
 
167 aa  153  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2807  hypothetical protein  42.77 
 
 
171 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3981  hypothetical protein  41.76 
 
 
183 aa  140  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10423  hypothetical protein  40 
 
 
171 aa  138  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.68603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2924  hypothetical protein  39.53 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2967  hypothetical protein  41.76 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3212  hypothetical protein  40 
 
 
169 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.480302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2050  hypothetical protein  41.18 
 
 
169 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3225  hypothetical protein  40 
 
 
169 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3205  hypothetical protein  40 
 
 
169 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3190  hypothetical protein  38.82 
 
 
169 aa  120  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0026  hypothetical protein  35.88 
 
 
172 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00874304  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5738  hypothetical protein  39.06 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.545411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2164  hypothetical protein  26.97 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2467  hypothetical protein  31.19 
 
 
174 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2528  hypothetical protein  25.32 
 
 
161 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2008  electron transport complex protein RnfC  32.86 
 
 
698 aa  41.6  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2252  electron transport complex protein RnfC  32.86 
 
 
659 aa  41.6  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00637467  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1896  electron transport complex protein RnfC  32.86 
 
 
698 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.813056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>