25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6529 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6529  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal  0.0666444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1402  hypothetical protein  56.72 
 
 
247 aa  276  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.526753  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0191  hypothetical protein  50.63 
 
 
253 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0804996  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1719  hypothetical protein  50 
 
 
239 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2096  hypothetical protein  48.55 
 
 
246 aa  208  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.756279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1215  EcsC protein  45.83 
 
 
235 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1154  EcsC protein  45.42 
 
 
235 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1086  EcsC protein  46.22 
 
 
235 aa  201  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0817  protein EcsC  45.04 
 
 
235 aa  201  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0965  EcsC protein  45.38 
 
 
235 aa  201  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1127  EcsC protein  45 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0960  EcsC-like protein  45.42 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1050  hypothetical protein  45.38 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4218  EcsC protein  45.8 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.518575  normal  0.0909474 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0970  protein EcsC  45.38 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0981  EcsC protein  45.38 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2555  hypothetical protein  47.62 
 
 
251 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347074  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3620  hypothetical protein  41.42 
 
 
249 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118154  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2086  hypothetical protein  26.53 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0529  hypothetical protein  25.51 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2633  hypothetical protein  29.22 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3309  hypothetical protein  26.28 
 
 
277 aa  53.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.287596  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1915  cation transporter E1-E2 family ATPase  23.87 
 
 
1068 aa  45.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2872  hypothetical protein  24.22 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3624  hypothetical protein  24.24 
 
 
288 aa  42  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>