19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5918 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5918  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  349  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0247  hypothetical protein  39.38 
 
 		 167 aa  108  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2729  hypothetical protein  35.93 
 
 		 164 aa  84.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1823  hypothetical protein  31.37 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0953844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0989  hypothetical protein  36.78 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0604  hypothetical protein  31.06 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00690  hypothetical protein  31.95 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0147  hypothetical protein  27.5 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2060  hypothetical protein  32.1 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0313  hypothetical protein  28.74 
 
 		 163 aa  72  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.686575  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1847  hypothetical protein  30.43 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2332  hypothetical protein  26.86 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000503232  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1968  hypothetical protein  28.12 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000218249  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0414  hypothetical protein  29.56 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.683154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2004  hypothetical protein  28.78 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1799  hypothetical protein  27.33 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1999  hypothetical protein  26.51 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000126346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2299  putative lipoprotein  29.86 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.340663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2115  lipoprotein, putative  28.83 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>