14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3932 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3932  hypothetical protein  100 
 
 		 921 aa  1916    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0926169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0364  hypothetical protein  29.75 
 
 		 821 aa  252  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1083  hypothetical protein  27.25 
 
 		 831 aa  225  2e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2457  hypothetical protein  28.06 
 
 		 866 aa  198  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0520379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2998  hypothetical protein  22.93 
 
 		 906 aa  196  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1046  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  26.33 
 
 		 895 aa  194  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5245  hypothetical protein  28.95 
 
 		 2204 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291359  hitchhiker  0.0000299325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3159  hypothetical protein  24.13 
 
 		 900 aa  191  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0980935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3605  hypothetical protein  26.38 
 
 		 863 aa  190  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000881284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0671  hypothetical protein  24.87 
 
 		 831 aa  172  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0666  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1193 aa  159  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2554  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1131 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1677  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1131 aa  108  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5244  hypothetical protein  39.13 
 
 		 175 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000191659  hitchhiker  0.000000566819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>