More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3401 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3401  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 1084 aa  2246    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3406  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 1104 aa  689    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3400  AMP-dependent synthetase and ligase  41.48 
 
 		 1083 aa  831    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  33.91 
 
 		 2457 aa  644    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  32.26 
 
 		 2410 aa  592  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  28.78 
 
 		 6889 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  28.5 
 
 		 4196 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  28.58 
 
 		 3498 aa  483  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  28.48 
 
 		 3308 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  28.88 
 
 		 4572 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  30.96 
 
 		 3018 aa  475  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  29.07 
 
 		 3207 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  26.31 
 
 		 3086 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  26.31 
 
 		 3086 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  29.57 
 
 		 7122 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  30.31 
 
 		 5953 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  29.77 
 
 		 2894 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  30.23 
 
 		 5926 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  29.55 
 
 		 13537 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  29.25 
 
 		 4882 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  29.06 
 
 		 4478 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  28.65 
 
 		 4531 aa  466  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  28.64 
 
 		 6676 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  28.86 
 
 		 8646 aa  462  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  29.96 
 
 		 1568 aa  459  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  28.09 
 
 		 2193 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  29.21 
 
 		 5929 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  28.8 
 
 		 3395 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  28.14 
 
 		 1870 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.44 
 
 		 2138 aa  459  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  28.44 
 
 		 9498 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  27.63 
 
 		 2156 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  27.57 
 
 		 4468 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  27.73 
 
 		 2156 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  27.96 
 
 		 1870 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  28.81 
 
 		 3761 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  27.99 
 
 		 2156 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  28.33 
 
 		 3695 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  29.84 
 
 		 4080 aa  452  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  27.37 
 
 		 3432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  29.34 
 
 		 3453 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  27.25 
 
 		 4968 aa  445  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  27.34 
 
 		 4960 aa  445  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  29.27 
 
 		 4354 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  28.97 
 
 		 6661 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  27.54 
 
 		 3291 aa  441  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  28.42 
 
 		 8914 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  28.6 
 
 		 6006 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  27.19 
 
 		 4960 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  28.76 
 
 		 6081 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  28.02 
 
 		 3348 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  28.36 
 
 		 4747 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  27.39 
 
 		 6403 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  28.44 
 
 		 2561 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  28.57 
 
 		 6072 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  28.07 
 
 		 3002 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  28.84 
 
 		 2370 aa  436  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  28.03 
 
 		 3021 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  28.48 
 
 		 5213 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  29.79 
 
 		 3018 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  27.78 
 
 		 2448 aa  432  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  27.23 
 
 		 7168 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  25.9 
 
 		 2164 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  27.29 
 
 		 1550 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  28.2 
 
 		 3432 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1780  amino acid adenylation domain-containing protein  26.23 
 
 		 1922 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  27.41 
 
 		 5596 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  28.83 
 
 		 3328 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  28.03 
 
 		 4991 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  26.7 
 
 		 4502 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  27.09 
 
 		 2054 aa  426  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  28.83 
 
 		 3352 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  27.58 
 
 		 3291 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  27.97 
 
 		 5372 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  27.47 
 
 		 5328 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  26.24 
 
 		 1689 aa  415  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  28.79 
 
 		 2125 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  27.87 
 
 		 9175 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  26.75 
 
 		 1569 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  26.16 
 
 		 2581 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  26.46 
 
 		 5738 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  27.9 
 
 		 7785 aa  415  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  29.58 
 
 		 3639 aa  412  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  27.71 
 
 		 4342 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  28.4 
 
 		 5620 aa  412  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  27.52 
 
 		 3102 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  27.44 
 
 		 3470 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  27.51 
 
 		 4342 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  27.92 
 
 		 3718 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2696  amino acid adenylation domain-containing protein  28.18 
 
 		 1762 aa  405  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  27.07 
 
 		 1449 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  27.3 
 
 		 4332 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  27.77 
 
 		 7712 aa  402  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  29.02 
 
 		 7310 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  27.31 
 
 		 2250 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  26.87 
 
 		 4336 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  28.72 
 
 		 8211 aa  396  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  27.21 
 
 		 4318 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12405  peptide synthetase mbtE  27.68 
 
 		 1731 aa  396  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.517103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  26.73 
 
 		 4336 aa  393  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>