More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3400 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3401  AMP-dependent synthetase and ligase  41.59 
 
 		 1084 aa  840    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3400  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 1083 aa  2243    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3406  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 1104 aa  741    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  32.26 
 
 		 2457 aa  590  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  32.16 
 
 		 2410 aa  584  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  30.27 
 
 		 3308 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.85 
 
 		 4968 aa  489  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  31.3 
 
 		 6889 aa  485  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  28.48 
 
 		 4196 aa  485  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  30.01 
 
 		 4960 aa  482  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  30.54 
 
 		 3207 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  29.48 
 
 		 2156 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  29.19 
 
 		 2156 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  30.1 
 
 		 4960 aa  478  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  29.09 
 
 		 2156 aa  477  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  30.24 
 
 		 3018 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.62 
 
 		 2138 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  30.77 
 
 		 5953 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  29.9 
 
 		 6676 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  29.47 
 
 		 2164 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  28.57 
 
 		 4478 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.3 
 
 		 3432 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.12 
 
 		 4531 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  29.24 
 
 		 9498 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.77 
 
 		 5328 aa  465  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  31.61 
 
 		 6403 aa  466  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  30.02 
 
 		 2448 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  29.58 
 
 		 3498 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  29.17 
 
 		 2193 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  28.94 
 
 		 2054 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  30.09 
 
 		 7122 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  29.8 
 
 		 1568 aa  459  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  30.49 
 
 		 2370 aa  459  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  28.96 
 
 		 3086 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  30.34 
 
 		 8646 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  28.48 
 
 		 3086 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  29.95 
 
 		 5213 aa  455  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  29.08 
 
 		 3395 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  29.4 
 
 		 2581 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  29.27 
 
 		 4080 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  29.81 
 
 		 4354 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  30.43 
 
 		 13537 aa  446  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  28.68 
 
 		 3291 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  28.6 
 
 		 4502 aa  445  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  28.64 
 
 		 4747 aa  442  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  29.32 
 
 		 1870 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  29.35 
 
 		 4991 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  29.32 
 
 		 1870 aa  439  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  28.55 
 
 		 4468 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  28.38 
 
 		 4572 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  28.77 
 
 		 1689 aa  439  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  28.41 
 
 		 3695 aa  439  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  29.89 
 
 		 1550 aa  436  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  28.92 
 
 		 4342 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  28.79 
 
 		 4342 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  28.92 
 
 		 4336 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  28.83 
 
 		 3453 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  28.58 
 
 		 4336 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  28.93 
 
 		 6006 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  28.99 
 
 		 6072 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  28.53 
 
 		 2125 aa  432  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  28.4 
 
 		 7712 aa  431  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  28.99 
 
 		 6081 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  27.94 
 
 		 7168 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  28.2 
 
 		 3002 aa  429  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  29.44 
 
 		 2151 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  29.37 
 
 		 2386 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  29.81 
 
 		 4882 aa  426  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  29.08 
 
 		 3328 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  30.2 
 
 		 2154 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  28.37 
 
 		 3348 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  29.72 
 
 		 8914 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  28.85 
 
 		 4318 aa  422  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  29.08 
 
 		 3352 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  28.79 
 
 		 2385 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  27.96 
 
 		 3432 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.52 
 
 		 2385 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  28.75 
 
 		 3176 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  28.32 
 
 		 3470 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  28.95 
 
 		 6661 aa  416  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  28.28 
 
 		 2894 aa  416  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  28.36 
 
 		 3291 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  28.31 
 
 		 1569 aa  415  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.69 
 
 		 2385 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  27.77 
 
 		 3718 aa  415  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  28.93 
 
 		 4317 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  29.4 
 
 		 3761 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.28 
 
 		 2385 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.6 
 
 		 2385 aa  416  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  29.39 
 
 		 3018 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  27.93 
 
 		 2571 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.42 
 
 		 2385 aa  413  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  29.18 
 
 		 3021 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.42 
 
 		 2385 aa  413  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  28.29 
 
 		 5149 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  28.52 
 
 		 2386 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  27.52 
 
 		 5738 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  27.93 
 
 		 2571 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  29.06 
 
 		 5926 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  28.73 
 
 		 4332 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>