28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3137 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3137  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  263  5.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2015  hypothetical protein  81.89 
 
 
128 aa  225  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0984  hypothetical protein  47.24 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3178  hypothetical protein  47.24 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000283539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3235  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.22 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1217  hypothetical protein  38.02 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2219  hypothetical protein  29.23 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000125255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4900  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.22 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.032178  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4542  hypothetical protein  27.05 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0952662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4779  hypothetical protein  27.05 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4378  PhnB protein  27.05 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4388  PhnB protein  27.05 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0567187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4895  hypothetical protein  27.05 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00185304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4780  hypothetical protein  27.87 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4753  hypothetical protein  26.19 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4762  hypothetical protein  27.05 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3682  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.2 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3665  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.8 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0482  hypothetical protein  25.4 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226703 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1763  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.37 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3316  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.48 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.918478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3966  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.48 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  0.267495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5925  hypothetical protein  27.34 
 
 
142 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146885  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 
148 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148195  normal  0.867816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4221  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.224785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3596  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.19 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000394768  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4078  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.4 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4446  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.4 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>