42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1217 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1217  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  264  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3235  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.59 
 
 		 130 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2015  hypothetical protein  35.71 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3178  hypothetical protein  37.21 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000283539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3137  hypothetical protein  38.02 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0984  hypothetical protein  32.8 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.46 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3219  PhnB protein  25.98 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0939991  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3319  hypothetical protein  24.22 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361879  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.73 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  25.83 
 
 		 279 aa  45.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.56 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09360  hypothetical protein  24.58 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.502731  normal  0.891606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3241  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.28 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.656661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1646  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.51 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.123315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0846  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.4 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.87 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4453  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.28 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633412  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4186  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.64 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.62 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2043  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.03 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2623  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.05 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0294662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4559  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.58 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2219  hypothetical protein  25.23 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000125255  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2105  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.62 
 
 		 144 aa  42  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225475 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.41 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000314859  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08710  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2770  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.38 
 
 		 144 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00372425  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4446  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.05 
 
 		 140 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4078  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.05 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5290  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.91 
 
 		 137 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2829  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.6 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000111266  normal  0.0167858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2320  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.61 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4598  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2898  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.91 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5280  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.91 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61410  hypothetical protein  23.91 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.510351 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2580  hypothetical protein  23.66 
 
 		 135 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 		 138 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2484  hypothetical protein  23.66 
 
 		 135 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000939903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2277  hypothetical protein  23.66 
 
 		 135 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.9839499999999997e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2309  hypothetical protein  23.66 
 
 		 135 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000699699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>