20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2506 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2506  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  508  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2742  hypothetical protein  37.35 
 
 
179 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.890417  normal  0.834874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1643  hypothetical protein  63.33 
 
 
108 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.947428  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1961  hypothetical protein  70.37 
 
 
338 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.865494  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1449  hypothetical protein  38.16 
 
 
129 aa  49.7  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0268202  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1708  hypothetical protein  62.07 
 
 
180 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0416994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4788  hypothetical protein  24.88 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5151  hypothetical protein  24.88 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1755  hypothetical protein  28.75 
 
 
284 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5062  hypothetical protein  28.57 
 
 
278 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2564  hypothetical protein  38.98 
 
 
109 aa  45.8  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0644759  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0699  hypothetical protein  35.29 
 
 
171 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.385809  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1478  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  55.17 
 
 
76 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1720  hypothetical protein  65.22 
 
 
105 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0324758  normal  0.0484003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5035  hypothetical protein  30.16 
 
 
459 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1904  hypothetical protein  51.72 
 
 
105 aa  42.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.146176  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1938  hypothetical protein  46.34 
 
 
105 aa  42.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.352861  normal  0.0103155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2296  hypothetical protein  66.67 
 
 
105 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000823465  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5590  hypothetical protein  36.51 
 
 
459 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129061 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4937  hypothetical protein  33.33 
 
 
459 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>