34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1420 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1420  EutP/PduV family GTP-binding protein  100 
 
 
143 aa  297  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4901  hypothetical protein  52.14 
 
 
152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3275  hypothetical protein  51.43 
 
 
151 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4865  ethanolamine utilization protein, EutP  33.59 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0086  ethanolamine utilization protein-like protein  35.2 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2297  propanediol utilization protein PduV  35.71 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1041  ethanolamine utilization protein, EutP  34.69 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2226  ethanolamine utilization protein, EutP  29.51 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.183442  normal  0.381192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2233  ethanolamine utilization protein EutP  29.51 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2392  ethanolamine utilization protein, EutP  28.69 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2279  ethanolamine utilization protein, EutP  28.69 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0106069 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2648  ethanolamine utilization protein, EutP  28.37 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0887  ethanolamine utilization protein, EutP  28.57 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2179  ethanolamine utilization protein, EutP  27.87 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1291  ethanolamine utilization protein eutP  30.77 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3263  ethanolamine utilization protein-like  31.93 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1373  ethanolamine utilization protein EutP  30.08 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1728  ethanolamine utilization protein, EutP  29.75 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2836  ethanolamine utilization protein, EutP  31.94 
 
 
159 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2703  ethanolamine utilization protein, EutP  31.94 
 
 
159 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2729  ethanolamine utilization protein, EutP  31.94 
 
 
159 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2662  ethanolamine utilization protein EutP  31.94 
 
 
159 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2614  ethanolamine utilization protein, EutP  30.34 
 
 
159 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1937  ethanolamine utilization protein-like protein  27.73 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1209  ethanolamine utilization protein, EutP  28.17 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2590  ethanolamine utilization protein, EutP  28.17 
 
 
159 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2827  ethanolamine utilization protein, EutP  28.17 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1216  ethanolamine utilization protein, EutP  28.17 
 
 
159 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2738  ethanolamine utilization protein, EutP  28.17 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02352  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  28.17 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3682  ethanolamine utilization protein, EutP  28.17 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2607  ethanolamine utilization protein, EutP  28.17 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02314  hypothetical protein  28.17 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1228  putative ethanolamine utilization protein  22.3 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>