16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0298 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0298  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  752    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1607  hypothetical protein  32.7 
 
 
367 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1362  hypothetical protein  31.41 
 
 
390 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0609018  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2549  hypothetical protein  30.63 
 
 
383 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3682  hypothetical protein  34.06 
 
 
366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00939506  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0060  hypothetical protein  29.74 
 
 
368 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.272206 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0960  putative WfaX  27.81 
 
 
348 aa  119  7e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2095  hypothetical protein  30.95 
 
 
394 aa  119  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  28.57 
 
 
867 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1409  hypothetical protein  24.8 
 
 
376 aa  112  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.872031  hitchhiker  0.0084702 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3879  hypothetical protein  27.01 
 
 
354 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2618  hypothetical protein  28.71 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.568711  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1786  hypothetical protein  29.06 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2894  hypothetical protein  23.99 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0140  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  24.28 
 
 
867 aa  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.0838e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.9 
 
 
749 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>