16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0652 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0652  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  820    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.828544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2775  hypothetical protein  45.83 
 
 		 412 aa  391  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.717789  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1573  hypothetical protein  46.77 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0398  hypothetical protein  44.7 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0194907  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1807  hypothetical protein  44.5 
 
 		 411 aa  365  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1845  hypothetical protein  46.19 
 
 		 411 aa  360  2e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1682  hypothetical protein  43.11 
 
 		 422 aa  349  5e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2045  hypothetical protein  44.05 
 
 		 408 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107819  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1102  hypothetical protein  27.13 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1818  hypothetical protein  30.77 
 
 		 238 aa  89.7  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0814  LigA  34.07 
 
 		 557 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0862  LigA  32.97 
 
 		 544 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0866  LigA  32.97 
 
 		 542 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  31.76 
 
 		 760 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  31.76 
 
 		 748 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  31.76 
 
 		 749 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>