27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1387 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1387  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1342  hypothetical protein  97.5 
 
 
80 aa  164  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  44.78 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  36.99 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  38.57 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  35.06 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  41.18 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0492  hypothetical protein  38.96 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29977  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  34.29 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1439  hypothetical protein  37.66 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.766966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  43.08 
 
 
91 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  43.08 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  36.36 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  37.66 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1097  hypothetical protein  36.49 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  38.89 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  32.86 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2658  hypothetical protein  37.68 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0823788  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00619  hypothetical protein  36.11 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0265  hypothetical protein  35.44 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0622  hypothetical protein  39.34 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000178223  unclonable  0.0000000000835363 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  31.43 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2376  hypothetical protein  37.68 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  28.57 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  31.75 
 
 
94 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  40.3 
 
 
91 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>