22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1988 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1988  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  471  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1280  hypothetical protein  55.11 
 
 
233 aa  262  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1455  hypothetical protein  49.54 
 
 
224 aa  228  9e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000773968  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0764  hypothetical protein  48.21 
 
 
222 aa  226  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0471664  normal  0.441546 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf079  conserved hypothetical protein, possible DNA alkylation repair enzyme  45.25 
 
 
246 aa  193  2e-48  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.389712  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1460  hypothetical protein  42.27 
 
 
230 aa  190  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0820  hypothetical protein  31.47 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2175  hypothetical protein  30 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.094597  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0119  hypothetical protein  33.48 
 
 
235 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1508  hypothetical protein  31.36 
 
 
223 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00485702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  22.77 
 
 
237 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  22.77 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  22.77 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  22.77 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  22.28 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  22.77 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  25.41 
 
 
263 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  22.93 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  23.33 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  29.78 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  21.95 
 
 
237 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  21.46 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>