12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1009 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1009  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  100 
 
 		 667 aa  1392    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  21.55 
 
 		 715 aa  92  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0607  Beta-galactosidase  19.43 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0621  Beta-galactosidase  19.43 
 
 		 672 aa  61.6  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.627864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3380  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  20.04 
 
 		 699 aa  57.4  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  20.24 
 
 		 649 aa  55.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  20.24 
 
 		 649 aa  55.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  23.86 
 
 		 672 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  26.06 
 
 		 713 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2648  Beta-galactosidase  20.38 
 
 		 710 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  20.11 
 
 		 685 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  22.52 
 
 		 701 aa  44.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>