12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0811 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0811  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0812  hypothetical protein  62.56 
 
 		 196 aa  227  9e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1453  hypothetical protein  31.63 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1613  hypothetical protein  29.02 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0233  hypothetical protein  30.18 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7021  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0126  hypothetical protein  30.63 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1517  hypothetical protein  28.64 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  26.5 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  26.5 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  30.08 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  32.14 
 
 		 203 aa  41.2  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>