22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0396 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0396  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  293  6e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0737  hypothetical protein  44.14 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02620  hypothetical protein  40.97 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2555  hypothetical protein  37.93 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3661  hypothetical protein  32.87 
 
 		 155 aa  76.6  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3253  hypothetical protein  34.07 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0897  hypothetical protein  32.87 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4171  hypothetical protein  41.86 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000102963  hitchhiker  0.000000290643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1159  hypothetical protein  33.94 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2059  hypothetical protein  35.66 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.535372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0815  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6869  hypothetical protein  30.6 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.640003  normal  0.119892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4139  hypothetical protein  26.39 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5793  hypothetical protein  25.74 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2548  hypothetical protein  28.38 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3775  hypothetical protein  28.28 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0018527  hitchhiker  0.00917662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0181  hypothetical protein  25.53 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000752164  normal  0.677539 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  41.07 
 
 		 230 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  41.07 
 
 		 227 aa  40.8  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1779  hypothetical protein  33.57 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155662  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  39.29 
 
 		 230 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  39.29 
 
 		 230 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>