10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0871 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0871  prefoldin, alpha subunit  100 
 
 
157 aa  310  6.999999999999999e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0461  prefoldin subunit alpha  24.8 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.735379  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0395  prefoldin subunit alpha  27.59 
 
 
145 aa  52  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0549936 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1477  hypothetical protein  29.51 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000022612  hitchhiker  0.000493368 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1321  prefoldin, alpha subunit  27.81 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.189768  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0430  prefoldin, alpha subunit  32.08 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0111  prefoldin subunit alpha  29.09 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.162217  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1966  prefoldin, alpha subunit  24.43 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1606  prefoldin subunit alpha  27.13 
 
 
136 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15712  predicted protein  26.42 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>