16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0800 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0800  solute binding protein-like protein  100 
 
 
919 aa  1824    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1418  cell wall anchor domain-containing protein  29.43 
 
 
863 aa  283  1e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.939763  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0975  oligopeptide binding protein, putative  29.99 
 
 
867 aa  278  3e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.200479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0913  cell wall anchor domain-containing protein  29.36 
 
 
868 aa  270  1e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.694923 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1897  cell wall anchor domain-containing protein  29.19 
 
 
878 aa  263  8e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0618  solute binding protein-like protein  24.55 
 
 
820 aa  217  8e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2228  conserved hypothetical protein  27.74 
 
 
903 aa  203  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0149  solute binding protein-like protein  24.47 
 
 
895 aa  146  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.450727  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1074  solute binding protein-like protein  20.59 
 
 
843 aa  125  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.297086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2180  solute binding protein-like protein  22.29 
 
 
862 aa  123  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521964  normal  0.207273 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1065  oligopeptide binding protein, putative  23.13 
 
 
701 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000159871  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1072  putative lipoprotein  28.17 
 
 
871 aa  95.1  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000214841  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0396  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 
868 aa  89.4  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13080  lipoprotein, putative  22.66 
 
 
612 aa  80.1  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13090  lipoprotein, putative  36.25 
 
 
198 aa  53.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 
607 aa  45.1  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000010438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>