12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0377 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0377  chromosome segregation ATPase-like protein  100 
 
 
465 aa  889    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0555604  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0603  hypothetical protein  29.68 
 
 
415 aa  123  7e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.614789 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0598  hypothetical protein  27.19 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0801  hypothetical protein  29.29 
 
 
407 aa  89  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1568  hypothetical protein  27.07 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0788  chemotaxis sensory transducer  26.28 
 
 
529 aa  81.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  23.95 
 
 
1682 aa  53.1  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  26.61 
 
 
4526 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  21.2 
 
 
278 aa  44.3  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  24.31 
 
 
1153 aa  43.5  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  26.02 
 
 
980 aa  43.1  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  30.71 
 
 
1147 aa  43.1  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>