15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1996 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0495  hypothetical protein  50.51 
 
 
687 aa  665    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.591683  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1996  hypothetical protein  100 
 
 
673 aa  1378    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0498  hypothetical protein  48.68 
 
 
678 aa  649    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1687  hypothetical protein  47.66 
 
 
692 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0543  hypothetical protein  42.13 
 
 
686 aa  520  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0478  hypothetical protein  44.2 
 
 
656 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.522287  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0442  hypothetical protein  42.9 
 
 
667 aa  488  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.57789  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3878  hypothetical protein  26.92 
 
 
705 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5160  hypothetical protein  26.61 
 
 
692 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.307901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2537  hypothetical protein  24.02 
 
 
675 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2457  hypothetical protein  26.96 
 
 
663 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6882  hypothetical protein  24.35 
 
 
669 aa  147  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1497  hypothetical protein  23.05 
 
 
685 aa  139  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.559508 
 
 
-
 
NC_002950  PG1977  hypothetical protein  27.21 
 
 
668 aa  85.5  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1174  hypothetical protein  22.66 
 
 
658 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>