15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1072 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1072  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 264 aa  545  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1270  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  74.05 
 
 		 268 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1076  hypothetical protein  71.1 
 
 		 280 aa  394  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1134  hypothetical protein  61.26 
 
 		 268 aa  323  3e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.61666  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.24 
 
 		 267 aa  318  6e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1499  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.7 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1123  xylose isomerase domain-containing protein  52.29 
 
 		 269 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2597  xylose isomerase domain-containing protein  27.97 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1679  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.9 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.917084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3496  hypothetical protein  26.52 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0856  hypothetical protein  26.27 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2481  hypothetical protein  25.3 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0343  hypothetical protein  24.14 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.017583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3122  hypothetical protein  24.76 
 
 		 204 aa  49.3  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1367  hypothetical protein  27.34 
 
 		 220 aa  48.9  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>