38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0583 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0583  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 68 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1759  transposase IS3/IS911 family protein  91.53 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1903  transposase IS3/IS911 family protein  91.53 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1295  transposase IS3/IS911 family protein  89.83 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0939  transposase IS3/IS911 family protein  89.83 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1305  transposase IS3/IS911 family protein  89.83 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1894  transposase IS3/IS911 family protein  89.83 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1955  transposase IS3/IS911 family protein  88.14 
 
 		 97 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2113  transposase IS3/IS911 family protein  88.14 
 
 		 97 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2729  transposase IS3/IS911 family protein  75.44 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0136  transposase IS3/IS911 family protein  75.44 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0185  transposase IS3/IS911 family protein  75.44 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.204073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1881  transposase IS3/IS911 family protein  75.44 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0078  transposase IS3/IS911 family protein  68.42 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2105  transposase IS3/IS911 family protein  94.87 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3029  hypothetical protein  59.65 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0430  transposase IS3/IS911 family protein  63.16 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3664  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 95 aa  57  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0237  transposase IS3/IS911 family protein  45.76 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1692  transposase  41.51 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0202  putative transposase  41.51 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00346911  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  46.55 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2431  putative transposase  41.38 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1611  IS3 family transposase orfA  41.51 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  46.55 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  46.55 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  46.55 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4204  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1736  transposase  43.4 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0773  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0293  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0082  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0976  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.163321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1326  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0172705  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4376  transposase IS3/IS911  37.74 
 
 		 103 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4500  transposase IS3/IS911 family protein  37.74 
 
 		 103 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5937  transposase IS3/IS911  35.19 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653759  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  38.18 
 
 		 95 aa  40  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>