19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0398 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0398  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  826    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0194907  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1807  hypothetical protein  54.82 
 
 		 411 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2775  hypothetical protein  52.53 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.717789  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1573  hypothetical protein  54.74 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2045  hypothetical protein  51.5 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107819  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1845  hypothetical protein  53.81 
 
 		 411 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1682  hypothetical protein  49.23 
 
 		 422 aa  378  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0652  hypothetical protein  44.7 
 
 		 411 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.828544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1102  hypothetical protein  27.65 
 
 		 404 aa  177  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1818  hypothetical protein  29.28 
 
 		 238 aa  90.9  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0862  LigA  29.41 
 
 		 544 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0866  LigA  29.41 
 
 		 542 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0814  LigA  29.76 
 
 		 557 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  25.73 
 
 		 1076 aa  45.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  32.38 
 
 		 782 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  39.34 
 
 		 737 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  39.34 
 
 		 737 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  39.34 
 
 		 737 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.26 
 
 		 1054 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>